Грудь болит во второй фазе действительно из-за прогестерона:
"Прогестерон стимулирует развитие железистых элементов ткани молочной ​железы: под его воздействием концевые пузырьки увеличиваются в объеме​, становятся больше и крупнее. В это время женщина чувствует ​нагрубание и легкую болезненность груди."
А по поводу кисты, ну не страшно, я помню у меня в первый же цикл после лапоры была огромная киста фолликулярная, около 7 см! И грудь из-за этой кисты была тоже огромная, у меня такая грудь сейчас, но тогда то я была не беременна, а вот киста дала такой эффект. ))) Но она ушла с месячными. Ничего страшного. Мне сразу же выписали дюфастон на 10 дней и после того, как я закончила его принимать, кисты уже и след простыл.

просто интересно, прогестерон то не выделяется, так как вторая фаза не наступает, должна по идее в тряпочку молчать грудь, а она по инерции что ли болит?

Знаешь у меня так два раза кисту по УЗИ ставили-но оба раза после М все выходило. Так что дай Бог всее будет хорошо. Удачи тебе